Lloyd, Nya, Jay, Kai, Cole, Zane och Master Wu måste försvara deras ö-hem från den onde Lord Garmadon och hans Shark Army.
För att göra detta måste de bemästra Ninjagility-konsten som låter dem korsa NInjago genom att springa på väggar, hoppa högt och strida mot Ninjagos fiender för att levla upp och uppgradera deras ninjastridsskonster. Spelarna kan tämja Spinjitzus stridskonst för att försvara Ninjago tillsammans.
Spelet innehåller åtta stora, actionspäckade platser baserade på storyn från Lego Ninjago Movie. Varje plats innehåller sin egen unika Challenge Dojo där spelarna kan testas sina stridskunskaper och strida mot fiender med ökande svårighetsgrad. Med Battle Maps kan spelarna möte deras vänner och familjer i fyra olika spellägen, med lokal splitscreen för upp till fyra spelare.